養殖凈水設備按照原水→石英砂過濾→活性炭過濾→精密過濾→超濾凈化→紫外線殺菌→產水的次序對原水進行殺菌凈化，關于其這個殺菌凈化的具體的次序如下：
1. 原水。所謂的原水就是未經人為處理的水，多為自然界的地表水、地下水等，但是養殖廠也可以采用自來水作為進水進行殺菌凈化的處理。原水會先被輸入到原水箱里面去，然后再從原水箱流入到石英砂過濾器里面。
2. 石英砂過濾。石英砂過濾也就是進水在石英砂過濾器里面被過濾，其石英砂濾料會將進水當中懸浮物膠體顆粒、有機物、微生物以及重金屬物質等截留，讓進水得到凈化然后流入到活性炭過濾器當中。
3. 活性炭過濾。活性炭是一種很常見的過濾濾料，其能夠吸附水中的余氯、鐵銹、有機物、微生物等物質，經過石英砂過濾的進水會被活性炭過濾器進行進一步的處理，去除絕大多數的顆粒雜質和余氯物質。經過活性炭過濾之后進水就會進入到精密過濾器當中。
4. 精密過濾。精密過濾通常也叫做保安過濾，精密過濾的目的在于將水中的有可能對超濾系統造成傷害的物質去除，保證能進水不會對超濾系統及其超濾膜造成不良的影響。
5. 超濾凈化。超濾膜是超濾凈化的核心，超濾膜能將進水中絕大部分的膠體顆粒、大分子有機物、微生物以及重金屬離子等去除，讓離子鹽、水分子、小分子物質透過。其過濾效果與過濾精度也有很大的關系。
6. 紫外線殺菌。雖然超濾膜能將絕大部分的微生物去除，但是為了保險起見還是需要進紫外線的殺菌消毒。紫外線對于細菌病毒的殺除率能達到99.9%以上。
7. 產水。經過上述的次序的工藝處理，進水得到了殺菌凈化成為了產水。
養殖凈水設備采用石英砂過濾、活性炭過濾、保安過濾、超濾凈化以及紫外線殺菌等方式，對進水進行殺菌凈化。
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